Pelbagai program akademik dijalankan bagi meningkatkan prestasi dan kecemerlangan pelajar SMK Seremban 3.
Antara program yang dilaksanakan untuk meningkatkan kecemerlangan akademik pelajar.
Program bimbingan akademik bagi membantu pelajar mencapai keputusan cemerlang dalam peperiksaan.
Program teknik menjawab dan strategi pembelajaran bagi meningkatkan pencapaian pelajar.
Program intensif khas untuk calon SPM bagi meningkatkan prestasi menjelang peperiksaan sebenar.
Program kem akademik yang memberi pendedahan teknik pembelajaran dan motivasi kepada pelajar.
Platform pembelajaran digital yang digunakan untuk perkongsian bahan pembelajaran dan latihan.
Pengurusan jadual pembelajaran yang fleksibel bagi memberi fokus kepada mata pelajaran penting.